Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYJ3

SYTL1, Synaptotagmin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1Q8IYJ3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL1Q8IYJ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms