Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms