Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms