Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A5Q71RS6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A5Q71RS6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms