Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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USP43Q70EL4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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