Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms