Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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