Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FAM78BQ5VT40 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FAM78BQ5VT40 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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FAM78BQ5VT40 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM78BQ5VT40 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM78BQ5VT40 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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