Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms