Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms