Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms