Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LETM2Q2VYF4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETM2Q2VYF4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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