Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD2Q16342 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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