Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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