Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms