Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms