Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms