Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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