Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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NR1D2Q14995 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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NR1D2Q14995 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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NR1D2Q14995 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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NR1D2Q14995 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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