Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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