Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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