Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHAF1BQ13112 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHAF1BQ13112 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHAF1BQ13112 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHAF1BQ13112 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHAF1BQ13112 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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