Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD47Q08722 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CD47Q08722 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CD47Q08722 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms