Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA3Q08378 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms