Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms