Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms