Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms