Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms