Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms