Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms