Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VBP1P61758 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms