Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SUMO3P55854 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms