Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOSBP53539 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOSBP53539 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms