Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDST1P52848 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDST1P52848 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDST1P52848 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDST1P52848 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDST1P52848 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms