Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP4P49662 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP4P49662 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP4P49662 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms