Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms