Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC1A2P43004 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms