Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms