Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLT4P35916 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms