Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms