Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms