Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MARCKSP29966 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms