Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DMAP28067 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms