Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB1P16220 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB1P16220 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB1P16220 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB1P16220 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms