Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms