Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1374.4 ms