Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALX3O95076 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ALX3O95076 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALX3O95076 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms