Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF254O75437 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF254O75437 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF254O75437 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF254O75437 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF254O75437 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF254O75437 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms