Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNSO60931 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CTNSO60931 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNSO60931 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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