Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms